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如何挑選凝膠成像分析系統(tǒng)

[2011/3/22]

  曾經(jīng)在過(guò)去的很多年,科研人員需要通過(guò)不斷重復(fù)的工作對(duì)凝膠進(jìn)行保存,以記錄辛辛苦苦得來(lái)的凝膠結(jié)果,浪費(fèi)了很多時(shí)間與精力。自從凝膠成像儀的誕生以來(lái),科研人員已經(jīng)不再需要如此辛苦,他們可以利用現(xiàn)代化的手段快速而準(zhǔn)確的記錄下試驗(yàn)結(jié)果,并且可以方便地獲得分析和組織實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)。如今,凝膠成像分析系統(tǒng)已經(jīng)不僅僅是一種凝膠記錄的手段,普遍應(yīng)用于蛋白、DNA的凝膠記錄中了,更是一種印跡分析,數(shù)據(jù)獲得的方式。

  實(shí)際上,大多數(shù)凝膠成像分析系統(tǒng)在初期階段都是由差不多的部件組成的,并沒(méi)有什么本質(zhì)性的區(qū)別。但是AlphaInnotech的產(chǎn)品經(jīng)理HanhLee就曾說(shuō),“表面上看來(lái),所有的凝膠成像系統(tǒng)看上去和操作起來(lái)很相似:它們都有一個(gè)相機(jī)、一個(gè)暗箱與獲取和分析凝膠圖片的軟件。”但是,更深入的進(jìn)行了解,你就會(huì)發(fā)現(xiàn)大部分凝膠成像系統(tǒng)提供了不同的產(chǎn)品特性來(lái)滿足不同科學(xué)研究的需要。

  要挑選一個(gè)合適的凝膠成像系統(tǒng),各人需要根據(jù)目前的預(yù)算和將來(lái)研究需要來(lái)決定,市場(chǎng)上有眾多的類型和型號(hào)可供選擇,但是大家要?jiǎng)?wù)必記住經(jīng)常留意最新的產(chǎn)品動(dòng)向――快速發(fā)展的光學(xué)技術(shù)和成像分析軟件也許能實(shí)現(xiàn)你以前想都不敢想的方便操作。

  不同需求參考不同的參數(shù)

  我們先來(lái)看一下伯樂(lè)公司的產(chǎn)品,伯樂(lè)公司提供了各種不同的產(chǎn)品特性滿足客戶的不同科學(xué)研究需要。例如,伯樂(lè)公司的ChemiDocXRS系統(tǒng)就是為高分辨率的化學(xué)發(fā)光和熒光成像用途設(shè)計(jì)的。該系統(tǒng)的特點(diǎn)包括:1.3兆的超級(jí)冷卻CCD照相機(jī)、一個(gè)緊密不透光的暗室、一個(gè)抽屜式的透射儀、一個(gè)的由軟件控制變焦、聚焦、光圈的伸縮鏡頭。該公司還提供另外一種更基礎(chǔ)用途的型號(hào)GelDocXR,主要用于快速高分辨率成像,但沒(méi)有化學(xué)發(fā)光成像功能。該系統(tǒng)包含一個(gè)暗室、一個(gè)1.4兆像素的CCD照相機(jī)、UV和白光照明、EB濾光玻片和UV防護(hù)罩。GelDocXR系統(tǒng)也可以升級(jí)為ChemiDocXRS系統(tǒng),兩種系統(tǒng)都包含了圖像獲取和分析軟件——QuantityOne。

  Bio-Rad公司還提供兩種分辨率更高和靈敏度更好的凝膠成像系統(tǒng)型號(hào):VersaDocModel4000和VersaDocModel5000。VersaDocModel4000系統(tǒng)具備一個(gè)3.2兆像素的CCD相機(jī),該系統(tǒng)適用于蛋白組分析,例如可以利用QuantityOne1-D分析軟件來(lái)估計(jì)蛋白樣品的分子量和數(shù)量,也可以利用2-D分析軟件來(lái)分析蛋白表達(dá)產(chǎn)物的差異VersaDocModel5000系統(tǒng)則運(yùn)用了高量子效應(yīng)的CCD相機(jī),該相機(jī)通過(guò)冷光源來(lái)優(yōu)化低亮度情況下的圖片成像。

  另外一家業(yè)界著名的AlphaInnotech公司提供的產(chǎn)品充分考慮到了科學(xué)研究的需求與實(shí)際預(yù)算的矛盾,提供了一系列性價(jià)比不錯(cuò)的產(chǎn)品。比如目前相對(duì)新型和高端的產(chǎn)品——FluorChemHD2,這是一種可以用于化學(xué)發(fā)光、熒光、和可見(jiàn)光應(yīng)用的產(chǎn)品。

  AlphaInnotech公司推出的高端產(chǎn)品FluorChemHD2,直接希望能成為近期發(fā)展起來(lái)的冷CCD(cooledCCDcamera)相機(jī)技術(shù)的行業(yè)標(biāo)準(zhǔn),包括分辨率、靈敏度、動(dòng)態(tài)范圍和性能等方面的標(biāo)準(zhǔn)。而且AlphaInnotech也相信他們公司提供的相機(jī)產(chǎn)品的規(guī)格有著其他公司不能比擬之處:高分辨率(科學(xué)研究級(jí)的CCD)、4百萬(wàn)像素、低信噪比、低暗電流(darkcurrent)、絕對(duì)的和可調(diào)的制冷溫度(用于更高端的系統(tǒng))

  除了4百萬(wàn)像素的分辨率外,F(xiàn)luorChemHD2還提供了AlphaInnotech公司的AlphaEaseFC軟件。其特有的算法通過(guò)三維圖像輪廓成像、圖像銳化和降低信噪比等技術(shù)直接改進(jìn)了成像分辨率。AlphaEaseFC軟件提供了可以簡(jiǎn)單易用的單擊完成1D泳道分析、2D點(diǎn)密度、MW/Rf(分子量/遷移率)計(jì)算、克隆和細(xì)胞計(jì)數(shù)、微量滴定盤分析、芯片分析、物距測(cè)量和凝膠評(píng)分等功能。該軟件采用模塊化,便于客戶學(xué)習(xí),其宣稱1個(gè)小時(shí)內(nèi)用戶即可上手操作。

  另一方面,AlphaInnotech公司也提供給用戶一種經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的選擇——入門級(jí)的AlphaImagermini產(chǎn)品,這是一種實(shí)時(shí)的凝膠成像系統(tǒng),配有140萬(wàn)像素的攝像頭,只要具備一臺(tái)電腦(通過(guò)USB連接)、一臺(tái)UV透射儀就能使用。當(dāng)然這是一種stand-alone版的成像產(chǎn)品,也就意味著它不具備一些昂貴的系統(tǒng)提供的許多圖像分析選項(xiàng),經(jīng)濟(jì)實(shí)惠,是小型和擁擠的實(shí)驗(yàn)室的理想選擇之一。。

  最近ALPHA推出了全球首臺(tái)時(shí)尚型個(gè)人凝膠成像一體機(jī)—red。小巧的機(jī)身,僅有計(jì)算機(jī)機(jī)箱大小;超大觸摸屏的設(shè)計(jì),操作簡(jiǎn)單易學(xué);USB端口輸出方便。red™整合了先進(jìn)的成像技術(shù)和機(jī)載電腦系統(tǒng),外觀簡(jiǎn)約時(shí)尚,操作方便,是進(jìn)行常規(guī)凝膠成像的理想之選。red™每一個(gè)細(xì)節(jié)設(shè)計(jì)出發(fā)點(diǎn)都是讓用戶有更好的使用體驗(yàn)。有了red™,您可將繁瑣的安裝調(diào)試過(guò)程拋之腦后,您只需要將red™從包裝箱取出,接上電源,按下開(kāi)關(guān),軟件自行加載安裝。通過(guò)簡(jiǎn)潔直觀的觸摸屏,您即可進(jìn)行多種熒光/可見(jiàn)光染色凝膠成像分析。可用于拍照,打印或保存圖像,可以通過(guò)USB傳輸圖像到計(jì)算機(jī)上用于分析。適合公共實(shí)驗(yàn)室,多使用人群,是超負(fù)荷運(yùn)轉(zhuǎn)凝膠成像儀器的最佳選擇。

  可升級(jí)的重要性

  假如你現(xiàn)在就需要一臺(tái)凝膠成像系統(tǒng),雖然目前你們實(shí)驗(yàn)室很小并且預(yù)算很緊,或者你不需要很多花俏的凝膠成像系統(tǒng)的功能,但是預(yù)知將來(lái)可能會(huì)需要更多復(fù)雜的性能的時(shí)候,最好購(gòu)買一臺(tái)能允許你升級(jí)到滿足你將來(lái)需要的凝膠成像系統(tǒng)。

  有一些公司提供了這種服務(wù),比如AlphaInnotech公司——任何顧客購(gòu)買了帶有DE-500操作室的入門級(jí)凝膠成像系統(tǒng),就可以對(duì)系統(tǒng)進(jìn)行升級(jí)而不需要買一套全新的系統(tǒng)。另外以上提到的Bio-Rad公司的GelDocXR和ChemiDocXRS也是可升級(jí)的系統(tǒng)。

  總結(jié)

  總之選擇凝膠成像系統(tǒng)第一個(gè)需要考慮的您的需求,是觀察可見(jiàn)光、熒光還是化學(xué)發(fā)光?其次是考慮產(chǎn)品的性能,是否能拍出清晰銳利的照片?然后是產(chǎn)品的質(zhì)量,是否能夠勝任長(zhǎng)期工作,是否在5年內(nèi)不會(huì)出任何重大問(wèn)題?最后是售后服務(wù),能否對(duì)產(chǎn)品熟悉,快速解決處理發(fā)生的問(wèn)題或者客戶的疑問(wèn)?有些人還把利用該儀器曾經(jīng)發(fā)表的文章當(dāng)作參考。

  當(dāng)然選擇滿意的產(chǎn)品還需要預(yù)算足夠啊。