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新基因測序方法更精確分析單細胞

[2012/9/3]

  受限于現(xiàn)有技術(shù)的發(fā)展,對于單細胞水平的基因特性分析是生物學(xué)家和基因?qū)W家的長期夢想。近日,來自瑞典和美國的研究團隊發(fā)明一種被稱為“智能測序(SMART-SEQ)”基因測序方法用于輔助科學(xué)家對臨床相關(guān)的單細胞進行更精確分析,這對于研究腫瘤發(fā)展的復(fù)雜進程和治致病機理具有重要意義。

  此前的研究顯示,單基因能夠通過對原始部分進行不同的剪切和粘貼改變其結(jié)構(gòu),形成同類蛋白質(zhì)的不同表現(xiàn)形式。這種被稱為“拼接(splicing)”的現(xiàn)象表明來自相同組織的細胞不一定同質(zhì)。本項研究則開發(fā)出一種將單個細胞的基因表達進行完全解析,通過顯示活躍的細胞,有可能精確描述來自相同組織的單個細胞基因表達的不同之處。

  這一技術(shù)可有多種應(yīng)用,如可研究單個患者腫瘤的細胞分型。研究人員對于多發(fā)性惡性黑色素瘤患者的血液系統(tǒng)腫瘤細胞進行研究。一旦在常規(guī)血檢中發(fā)現(xiàn)腫瘤細胞后,就用“智能測序(SMART-SEQ)”方法分析其基因表達。通過這種方法證明,癌細胞已經(jīng)激活對維持其能力至關(guān)重要的膜蛋白,以使癌細胞能夠逃避人體的監(jiān)控系統(tǒng),在血液或淋巴中傳播。

  該項目是由歐洲研究理事會出資支持的單細胞基因?qū)W研究項目支持,將持續(xù)到2015年,主要目標(biāo)是更好地了解多能干細胞的體內(nèi)分化期間的基因表達調(diào)控,具有重要的生物學(xué)和醫(yī)學(xué)影響。雖然目前該研究僅得到初步結(jié)果,但至少表明有可能針對單個臨床診斷相關(guān)的細胞進行分析,使癌癥研究人員能夠?qū)τ诩毎M行系統(tǒng)分析,為未來開發(fā)出更好的診斷和治療方法鋪平道路。