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如何選擇蛋白印跡成像與定量分析技術(shù)
[2013/3/20]
western blot技術(shù)在蛋白定量分析中的選擇應(yīng)用
蛋白質(zhì)印跡(western blot),它是根據(jù)抗原抗體的特異性結(jié)合檢測復(fù)雜樣品中的某種蛋白的方法。western blot 是在凝膠電泳和固相免疫測定技術(shù)基礎(chǔ)上發(fā)展起來的一種新的免疫生化技術(shù)。由于免疫印跡(western blot)具有SDS-PAGE 的高分辨力和固相免疫測定的高特異性和敏感性,現(xiàn)已成為蛋白分析的一種常規(guī)技術(shù)。免疫印跡(western blot)常用于鑒定某種蛋白,并能對蛋白進(jìn)行定性和半定量分析。
如何選擇蛋白印跡成像與定量分析技術(shù)?通常,Western Blot顯色的方法主要有以下幾種:1、放射自顯影;2、底物化學(xué)發(fā)光ECL;3、底物熒光ECF;4、底物DAB呈色等。下面我們將分別對這四種方法進(jìn)行介紹,同時向大家呈現(xiàn)每種方法的應(yīng)用特點(diǎn)。
放射自顯影radioautography:利用放射性核素發(fā)射的射線,使感光材料中的鹵化銀等感光,顯出影像后進(jìn)行放射性標(biāo)記物的定位和定量測量的技術(shù)。此技術(shù)的特點(diǎn)是靈敏度高、分辨率好、保存時間長久,但由于實(shí)驗(yàn)所用方式性物質(zhì)對人體有輻射作用,目前該技術(shù)在蛋白研究中應(yīng)用較少,多用于研究標(biāo)記化合物在機(jī)體、組織和細(xì)胞中的分布、定位、排出以及合成、更新、作用機(jī)理、作用部位等等。
底物DAB呈色:二氨基聯(lián)苯胺(Diaminobenzidine,DAB)是辣根過氧化物酶最敏感、最常用的顯色底物,反應(yīng)產(chǎn)物因不溶于水、二甲苯和醇的棕色沉淀物而被廣泛地用于蛋白印跡(Western Blot,WB)、免疫組織化學(xué)(Immunohistochemistry,IHC)和免疫細(xì)胞化學(xué)(Immunocytochemistry,ICC)、斑點(diǎn)印跡(Dot blot)和生物芯片(Biochip)等的染色和顯色反應(yīng)。用之進(jìn)行對底物顯色即被稱為底物DAB呈色法。此技術(shù)成本低,操作也較簡單是常用的western blot成像分析技術(shù)之一,不過由于其靈敏度稍低,在目的蛋白表達(dá)量較少的情況下可能沒有理想的結(jié)果應(yīng)慎用。
底物化學(xué)發(fā)光ECL:化學(xué)發(fā)光是在一些特殊的化學(xué)反應(yīng)中吸收了反應(yīng)釋放的化學(xué)能,而處于電子激發(fā)態(tài)的反應(yīng)中間體或反應(yīng)產(chǎn)物由激發(fā)態(tài)回到基態(tài)時所產(chǎn)生的一種光輻射,化學(xué)發(fā)光分析是根據(jù)化學(xué)反應(yīng)產(chǎn)物的光輻射(化學(xué)發(fā)光)確定物質(zhì)含量的一種痕量分析方法。它的特點(diǎn)是靈敏度高和線性范圍寬,不需要任何光源。
傳統(tǒng)的化學(xué)發(fā)光檢測方法通常需要膠片成像,膠片成像可以保證較高的靈敏度,但也有很多缺點(diǎn):耗時,需要暗房和顯影劑,膠片很貴,而且需要很多消耗品,需要持續(xù)購買。另外,用膠片上的蛋白條帶進(jìn)行定量也是幾乎不可能,和目測一塊考馬斯藍(lán)染的膠沒什么區(qū)別,而且膠片成像時間只能預(yù)先設(shè)定,如果曝光過度或者不足則需要再次進(jìn)行實(shí)驗(yàn),非常麻煩。
數(shù)字成像系統(tǒng)的出現(xiàn)極大克服了傳統(tǒng)膠片法的一些弊端,近年來隨著冷卻CCD技術(shù)的發(fā)展,數(shù)字成像系統(tǒng)成本越來越低,成像效果同時獲得大大提升,因而CCD成像系統(tǒng)逐漸成為了實(shí)驗(yàn)室Western Blot的主要設(shè)備。同時目前很多Western blot的新技術(shù)也都是針對CCD成像系統(tǒng)的,目前CCD成像系統(tǒng)的靈敏度已經(jīng)可以達(dá)到甚至超過傳統(tǒng)的膠片成像。冷卻型CCD照相機(jī)與X膠片相比具有瞬時影像處理、高靈敏度、高分辨率、動力學(xué)范圍廣等優(yōu)點(diǎn),而且還不需要膠片處理裝置、后續(xù)耗材投入及暗室。
底物熒光ECF:是利用的熒光染料(如Cy2 ,Cy3, Cy5)標(biāo)記二抗,標(biāo)記熒光染料的二
抗分別對應(yīng)相應(yīng)的目的蛋白,以此實(shí)現(xiàn)通過檢測熒光染料的信號強(qiáng)度,實(shí)現(xiàn)種蛋白信號的檢測,以進(jìn)行精確的定量分析。熒光檢測Western Blot本來不是檢測的主流方法,不過熒光法檢測允許在同一張轉(zhuǎn)印膜上用不同顏色的熒光底物同時檢測不同的目標(biāo)。
在做western blot的檢測時,有時會碰到電泳后兩個分子量相近的蛋白分離不開,距離相近或者重疊,例如磷酸化和非磷酸化的蛋白;或者是同一次實(shí)驗(yàn)中,檢測一種以上的蛋白抑或是利用內(nèi)參蛋白對目的蛋白的定量分析進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化。遇到以上這樣的實(shí)驗(yàn)需求,化學(xué)發(fā)光的檢測方法會顯得繁瑣復(fù)雜,其必須經(jīng)過剝脫抗體和重行孵育新抗體的過程,不僅耗時費(fèi)力,而且不能進(jìn)行精確的定量分析,由此多色熒光成像的技術(shù)應(yīng)運(yùn)而生。多色熒光成像,是利用不同的熒光染料(如Cy2 ,Cy3, Cy5)標(biāo)記二抗,標(biāo)記不同熒光染繞的二抗分別對應(yīng)不同的目的蛋白,以此實(shí)現(xiàn)通過檢測不同熒光染料的信號強(qiáng)度,間接實(shí)現(xiàn)一次實(shí)驗(yàn)可檢測多種蛋白,同時也可以進(jìn)行精確的定量分析。
總之,經(jīng)典的western blot技術(shù)結(jié)合不斷進(jìn)步的科學(xué)技術(shù),使蛋白定量分析更靈敏、操作更加簡便。同時,western blot技術(shù)儀器也更加專一、高效,這就要求我們在開展western blot實(shí)驗(yàn)時,需要就如何選擇蛋白印跡成像與定量分析技術(shù)進(jìn)行選擇確定,以保證選擇工具的適用性。
蛋白質(zhì)印跡(western blot),它是根據(jù)抗原抗體的特異性結(jié)合檢測復(fù)雜樣品中的某種蛋白的方法。western blot 是在凝膠電泳和固相免疫測定技術(shù)基礎(chǔ)上發(fā)展起來的一種新的免疫生化技術(shù)。由于免疫印跡(western blot)具有SDS-PAGE 的高分辨力和固相免疫測定的高特異性和敏感性,現(xiàn)已成為蛋白分析的一種常規(guī)技術(shù)。免疫印跡(western blot)常用于鑒定某種蛋白,并能對蛋白進(jìn)行定性和半定量分析。
如何選擇蛋白印跡成像與定量分析技術(shù)?通常,Western Blot顯色的方法主要有以下幾種:1、放射自顯影;2、底物化學(xué)發(fā)光ECL;3、底物熒光ECF;4、底物DAB呈色等。下面我們將分別對這四種方法進(jìn)行介紹,同時向大家呈現(xiàn)每種方法的應(yīng)用特點(diǎn)。
放射自顯影radioautography:利用放射性核素發(fā)射的射線,使感光材料中的鹵化銀等感光,顯出影像后進(jìn)行放射性標(biāo)記物的定位和定量測量的技術(shù)。此技術(shù)的特點(diǎn)是靈敏度高、分辨率好、保存時間長久,但由于實(shí)驗(yàn)所用方式性物質(zhì)對人體有輻射作用,目前該技術(shù)在蛋白研究中應(yīng)用較少,多用于研究標(biāo)記化合物在機(jī)體、組織和細(xì)胞中的分布、定位、排出以及合成、更新、作用機(jī)理、作用部位等等。
底物DAB呈色:二氨基聯(lián)苯胺(Diaminobenzidine,DAB)是辣根過氧化物酶最敏感、最常用的顯色底物,反應(yīng)產(chǎn)物因不溶于水、二甲苯和醇的棕色沉淀物而被廣泛地用于蛋白印跡(Western Blot,WB)、免疫組織化學(xué)(Immunohistochemistry,IHC)和免疫細(xì)胞化學(xué)(Immunocytochemistry,ICC)、斑點(diǎn)印跡(Dot blot)和生物芯片(Biochip)等的染色和顯色反應(yīng)。用之進(jìn)行對底物顯色即被稱為底物DAB呈色法。此技術(shù)成本低,操作也較簡單是常用的western blot成像分析技術(shù)之一,不過由于其靈敏度稍低,在目的蛋白表達(dá)量較少的情況下可能沒有理想的結(jié)果應(yīng)慎用。
底物化學(xué)發(fā)光ECL:化學(xué)發(fā)光是在一些特殊的化學(xué)反應(yīng)中吸收了反應(yīng)釋放的化學(xué)能,而處于電子激發(fā)態(tài)的反應(yīng)中間體或反應(yīng)產(chǎn)物由激發(fā)態(tài)回到基態(tài)時所產(chǎn)生的一種光輻射,化學(xué)發(fā)光分析是根據(jù)化學(xué)反應(yīng)產(chǎn)物的光輻射(化學(xué)發(fā)光)確定物質(zhì)含量的一種痕量分析方法。它的特點(diǎn)是靈敏度高和線性范圍寬,不需要任何光源。
傳統(tǒng)的化學(xué)發(fā)光檢測方法通常需要膠片成像,膠片成像可以保證較高的靈敏度,但也有很多缺點(diǎn):耗時,需要暗房和顯影劑,膠片很貴,而且需要很多消耗品,需要持續(xù)購買。另外,用膠片上的蛋白條帶進(jìn)行定量也是幾乎不可能,和目測一塊考馬斯藍(lán)染的膠沒什么區(qū)別,而且膠片成像時間只能預(yù)先設(shè)定,如果曝光過度或者不足則需要再次進(jìn)行實(shí)驗(yàn),非常麻煩。
數(shù)字成像系統(tǒng)的出現(xiàn)極大克服了傳統(tǒng)膠片法的一些弊端,近年來隨著冷卻CCD技術(shù)的發(fā)展,數(shù)字成像系統(tǒng)成本越來越低,成像效果同時獲得大大提升,因而CCD成像系統(tǒng)逐漸成為了實(shí)驗(yàn)室Western Blot的主要設(shè)備。同時目前很多Western blot的新技術(shù)也都是針對CCD成像系統(tǒng)的,目前CCD成像系統(tǒng)的靈敏度已經(jīng)可以達(dá)到甚至超過傳統(tǒng)的膠片成像。冷卻型CCD照相機(jī)與X膠片相比具有瞬時影像處理、高靈敏度、高分辨率、動力學(xué)范圍廣等優(yōu)點(diǎn),而且還不需要膠片處理裝置、后續(xù)耗材投入及暗室。
底物熒光ECF:是利用的熒光染料(如Cy2 ,Cy3, Cy5)標(biāo)記二抗,標(biāo)記熒光染料的二
抗分別對應(yīng)相應(yīng)的目的蛋白,以此實(shí)現(xiàn)通過檢測熒光染料的信號強(qiáng)度,實(shí)現(xiàn)種蛋白信號的檢測,以進(jìn)行精確的定量分析。熒光檢測Western Blot本來不是檢測的主流方法,不過熒光法檢測允許在同一張轉(zhuǎn)印膜上用不同顏色的熒光底物同時檢測不同的目標(biāo)。
在做western blot的檢測時,有時會碰到電泳后兩個分子量相近的蛋白分離不開,距離相近或者重疊,例如磷酸化和非磷酸化的蛋白;或者是同一次實(shí)驗(yàn)中,檢測一種以上的蛋白抑或是利用內(nèi)參蛋白對目的蛋白的定量分析進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化。遇到以上這樣的實(shí)驗(yàn)需求,化學(xué)發(fā)光的檢測方法會顯得繁瑣復(fù)雜,其必須經(jīng)過剝脫抗體和重行孵育新抗體的過程,不僅耗時費(fèi)力,而且不能進(jìn)行精確的定量分析,由此多色熒光成像的技術(shù)應(yīng)運(yùn)而生。多色熒光成像,是利用不同的熒光染料(如Cy2 ,Cy3, Cy5)標(biāo)記二抗,標(biāo)記不同熒光染繞的二抗分別對應(yīng)不同的目的蛋白,以此實(shí)現(xiàn)通過檢測不同熒光染料的信號強(qiáng)度,間接實(shí)現(xiàn)一次實(shí)驗(yàn)可檢測多種蛋白,同時也可以進(jìn)行精確的定量分析。
總之,經(jīng)典的western blot技術(shù)結(jié)合不斷進(jìn)步的科學(xué)技術(shù),使蛋白定量分析更靈敏、操作更加簡便。同時,western blot技術(shù)儀器也更加專一、高效,這就要求我們在開展western blot實(shí)驗(yàn)時,需要就如何選擇蛋白印跡成像與定量分析技術(shù)進(jìn)行選擇確定,以保證選擇工具的適用性。