傳統(tǒng)的高通量測(cè)序會(huì)產(chǎn)生不少錯(cuò)誤，掩蓋基因組中的罕見突變。前不久科學(xué)家們開發(fā)了一種新測(cè)序法，能夠成功從背景噪音中分離出信號(hào)，實(shí)現(xiàn)極為準(zhǔn)確的測(cè)序。

　　腫瘤是異質(zhì)性細(xì)胞的混合體，測(cè)序可以檢測(cè)其中的罕見突變，但成本較高而且容易出現(xiàn)錯(cuò)誤。華盛頓大學(xué)的研究團(tuán)隊(duì)為此開發(fā)了新測(cè)序技術(shù)，將靶序列純化與高精度的DNA測(cè)序法結(jié)合起來。這一成果發(fā)表在近日的Nature Methods雜志上。

　　“這一技術(shù)可以幫助人們檢測(cè)那些能夠抵抗靶向性藥物的突變，更好的監(jiān)控癌癥復(fù)發(fā)情況，”文章的資深作者，華盛頓大學(xué)的Lawrence Loeb說�！八梢耘c全基因組測(cè)序結(jié)合，為癌癥治療提供指導(dǎo)性的信息。”

　　這一測(cè)序技術(shù)主要是用生物素化的DNA寡核苷酸進(jìn)行兩輪捕獲，然后進(jìn)行雙重測(cè)序。雙重測(cè)序是Loeb等人之前開發(fā)的高精度測(cè)序技術(shù)，使用特殊的分子標(biāo)簽分別擴(kuò)增和測(cè)序DNA的兩條鏈。如果兩條鏈同一個(gè)位置上出現(xiàn)突變，該突變就被認(rèn)為是真實(shí)的;如果只在一條鏈上出現(xiàn)突變，該突變就被認(rèn)為是測(cè)序錯(cuò)誤。

　　研究人員使用生物素化的探針，在人類基因組中捕獲ABL1基因的外顯子。ABL1基因與伊馬替尼(imatinib)抗性有關(guān)，伊馬替尼是一種治療慢性粒細(xì)胞白血病CML的藥物。他們通過兩輪捕獲得到了極高的測(cè)序深度和覆蓋度(與傳統(tǒng)方法相比)。(延伸閱讀：遺傳學(xué)大牛Nature發(fā)表新技術(shù)：單分子互作測(cè)序)

　　研究人員選擇的是一名在接受伊馬替尼治療后復(fù)發(fā)的CML患者。傳統(tǒng)高通量測(cè)序沒有檢測(cè)出任何與藥物抗性有關(guān)的突變，而他們的新技術(shù)鑒定到了E279K突變，已知這個(gè)突變能夠抵抗伊馬替尼。

　　對(duì)外顯子組或者基因組進(jìn)行雙重測(cè)序的成本很高，但這種技術(shù)很適合測(cè)序較小的基因組區(qū)域，比如某個(gè)人類外顯子或者人類樣本中的病毒序列。

　　研究人員準(zhǔn)備用這一技術(shù)在不同癌癥患者中研究他們對(duì)藥物的敏感性和疾病復(fù)發(fā)的風(fēng)險(xiǎn)。他們還將進(jìn)一步優(yōu)化這一技術(shù)，以便測(cè)序單個(gè)循環(huán)腫瘤細(xì)胞�！俺税┌Y以外，這個(gè)技術(shù)還可以用于法醫(yī)檢測(cè)，”文章的第一作者，華盛頓大學(xué)的Michael Schmitt說。“這一技術(shù)可以幫助人們解決更多的生物學(xué)問題�！�