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基因測(cè)序技術(shù)偵破“跨國(guó)腹瀉案”

[2015/5/14]

  英國(guó)疾控部門一個(gè)快速反應(yīng)小組近日發(fā)表論文,還原了他們?cè)鯓永萌蚪M測(cè)序和食品溯源技術(shù),將一場(chǎng)跨國(guó)暴發(fā)的腸炎沙門氏菌疫情追溯到德國(guó)的一家禽蛋生產(chǎn)商。

  這次疫情最初發(fā)生在2014年5月~9月之間,涉及英國(guó)中部、西北部和南部的至少287個(gè)病例。同時(shí),腸炎沙門氏菌疫情也在法國(guó)和奧地利出現(xiàn)。這三國(guó)樣本中得到的分離菌經(jīng)過(guò)多位點(diǎn)可變數(shù)目串聯(lián)重復(fù)序列分析((MLVA)后,發(fā)現(xiàn)屬同一種。此后,相似病例出現(xiàn)在盧森堡和德國(guó)。

  法國(guó)疫情最先被溯源到一家德國(guó)禽蛋生產(chǎn)商。進(jìn)一步的溯源調(diào)查也顯示,其他疫情也同這家生產(chǎn)商有關(guān)。在這些國(guó)家的分離菌樣本都做了全基因組測(cè)序后,這一結(jié)論得到確認(rèn)。