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實(shí)驗(yàn)室儀器
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按專業(yè)實(shí)驗(yàn)室分- 化學(xué)合成
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基因測序揭示12種癌癥的遺傳易感性(含具體數(shù)據(jù))
[2015/12/25]
12月22日《Nature Communications》雜志上的一項(xiàng)研究闡述了12種癌癥的遺傳性,意外發(fā)現(xiàn)胃癌遺傳概率與乳腺癌等同,同時還揭示了乳腺癌易感基因BRCA1和BRCA2突變對其他癌癥的影響。
12種癌癥的遺傳性(遺傳性易感性)
長期以來,眾所周知癌癥的部分風(fēng)險(xiǎn)因素為遺傳,且遺傳突變在不同腫瘤中的重要性也不一致。華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院研究人員析了4000多個癌癥病例的基因信息,以研究癌癥的遺傳性。這些4000多個病例均來自美國國立衛(wèi)生研究院(NIH)組織的癌癥基因組圖譜項(xiàng)目。
過去的癌癥基因組研究主要是比較健康組織與癌變組織的測序結(jié)果,幫助研究人員確定哪些基因在癌癥的發(fā)展過程中扮演重要的角色,但這種分析不能區(qū)分遺傳突變是天生的還是后天形成的。
為了梳理癌癥的遺傳分量,研究人員在該研究中加入了包含患者胚胎信息的正常細(xì)胞相關(guān)測序數(shù)據(jù)的分析。患者生殖細(xì)胞系來自于父母,可揭示先天性的遺傳信息,判斷與癌癥相關(guān)的突變是否與生俱來。
本文資深作者,華盛頓大學(xué)McDonnell基因研究所醫(yī)學(xué)教授Li Ding博士說,“總體而言,我們已經(jīng)知道卵巢癌和乳腺癌有一個重要的遺傳因素,但其他類型的癌癥,如急性髓系白血病、肺癌等的遺傳性小一些!
研究人員在所有的分析病例中尋找已知的與癌癥相關(guān)的罕見生殖系突變。若出生時其中一個親本的一個基因中的一個拷貝發(fā)生了突變,來自另一個親本的正?截愅ǔ?蓪⒃撊毕菅谏w,但攜帶這種突變的個體更容易受到“第二次攻擊”,隨著年齡的增長,正?截惖幕虬l(fā)生突變的風(fēng)險(xiǎn)值越高。
在與癌癥相關(guān)的已知的114個基因中,研究人員發(fā)現(xiàn)了12種癌癥的種系突變,但突變頻率取決于癌癥的類型。研究人員專注于一種稱為“截?cái)?truncation)”的突變類型,因?yàn)榇蟛糠值慕囟袒?truncated gene)是不發(fā)揮功能的。這12種癌癥的遺傳性如下表所示:
LUNG1為肺鱗狀細(xì)胞癌,LUNG2為肺腺癌
在本次調(diào)查中,19%的卵巢癌病例攜帶罕見的生殖系“截?cái)唷蓖蛔,相比之下,僅有4%的急性髓系白血病患者攜帶這種突變,同時研究人員發(fā)現(xiàn)胃癌患者攜帶這種突變的概率為11%,與乳腺癌患者相當(dāng)。該研究結(jié)果可提高癌癥風(fēng)險(xiǎn)基因檢測的準(zhǔn)確性。
乳腺癌易感基因BRCA1和BRCA2可能影響其他癌癥的形成
BRCA1和BRCA2基因?qū)NA修復(fù)很重要,且一直以來被認(rèn)為與乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)相關(guān),但該研究揭示了這兩個基因可能有更廣泛的影響。
“我們發(fā)現(xiàn)大量的BRCA1和BRCA2基因生殖系’截?cái)唷蛔儼l(fā)生于乳腺癌以外的腫瘤,包括胃癌和前列腺癌”,Ding說,“這表明我們應(yīng)注意這兩個基因可能潛在地參與了其他類型癌癥的發(fā)展。BRCA1基因發(fā)生生殖系截?cái)嗤蛔兊幕颊撸?0%的BRCA1截?cái)嗤蛔冊谀[瘤組織中擴(kuò)增,且與癌癥類型無關(guān)。”
對已知乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)高的女性進(jìn)行BRCA1和BRCA2基因檢測可提供重要的預(yù)防信息。例如,當(dāng)基因型正常時乳腺癌遺傳風(fēng)險(xiǎn)值不會升高,但如果其中一個基因發(fā)生了一些可使另外一個基因失效的突變,那么乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)會大大增加。
突變的類型多種多樣,基因測序還可揭示這些基因突變的許多未知結(jié)果,且目前這些突變對癌癥風(fēng)險(xiǎn)的影響也是無法預(yù)測的。為了弄清臨床實(shí)踐中的灰色地帶,Ding及其同事俄亥俄州立大學(xué)計(jì)算機(jī)生物學(xué)和生物信息學(xué)家Jeffrey Parvin博士和華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)教授Feng Chen博士研究了BRAC1基因中意義不明確的68個種系非截?cái)嗤蛔凅w。對于每一種突變,研究人員均測試了BRAC1蛋白如何執(zhí)行其DNA修復(fù)的功能,結(jié)果發(fā)現(xiàn)其中6個突變體表現(xiàn)出了完全截?cái)嘈?yīng)——使基因完全失效,且這些突變在腫瘤中含量非常豐富,在癌癥發(fā)展中可能扮演著不同的角色。
Ding表示,“揭示這六個未知突變的臨床意義非常重要(實(shí)際上它們是導(dǎo)致基因功能喪失的突變)。但同時我想強(qiáng)調(diào)結(jié)果的對比性,許多類型的突變(至少在我們的研究中)是中性的,我們想將其識別出來使衛(wèi)生保健提供者能給患者提出更好的建議。但將此研究結(jié)果納入臨床之前還需更多的研究來證實(shí)。”