現(xiàn)行食品安全微生物學(xué)檢驗(yàn)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)基本以培養(yǎng)分離法為主，而這些檢測(cè)方法由于人為干擾、交叉污染及其方法本身的局限性，會(huì)對(duì)檢測(cè)造成較大風(fēng)險(xiǎn)：可靠性較低、重現(xiàn)性較差、周期長(zhǎng)、依賴(lài)專(zhuān)業(yè)人員的判斷能力和從業(yè)經(jīng)驗(yàn)等主觀因素，耗費(fèi)人力物力，導(dǎo)致檢測(cè)風(fēng)險(xiǎn)變大而效率變低，妨礙了標(biāo)準(zhǔn)化質(zhì)控管理，降低了用戶(hù)出具報(bào)告時(shí)的自信心。

　　調(diào)研發(fā)現(xiàn)，現(xiàn)行標(biāo)準(zhǔn)的執(zhí)行存在以下困難：首先，人為干擾：大量人工操作、主觀判斷因素等導(dǎo)致批間差異較大，缺乏重現(xiàn)性。其次，交叉污染：微生物環(huán)境、人員、器具和儀器之間易產(chǎn)生交叉污染。再次，經(jīng)驗(yàn)缺乏：專(zhuān)業(yè)人員的培訓(xùn)困難、耗時(shí)。同時(shí)實(shí)驗(yàn)室檢驗(yàn)人員的資質(zhì)、經(jīng)驗(yàn)和主觀判斷力也極大影響了數(shù)據(jù)可靠性和檢驗(yàn)結(jié)論的正確性。最后，方法存在許多局限：1、靈敏度和特異性低，漏檢率高：如沙門(mén)氏菌檢出率比分子生物學(xué)方法低12.5%，大腸桿菌O157:H7檢出率低45.3%。國(guó)內(nèi)食源性致病微生物監(jiān)測(cè)能力有限，漏檢率極高。WHO顯示，發(fā)展中國(guó)家的漏檢率>95%。2、培養(yǎng)基質(zhì)量：國(guó)內(nèi)的培養(yǎng)基質(zhì)量層次不齊，影響檢測(cè)結(jié)果。3、食品種類(lèi)對(duì)檢出結(jié)果影響大：檢測(cè)結(jié)果易受抽樣品種和抽樣量影響。目前許多檢測(cè)法都沒(méi)通過(guò)權(quán)威機(jī)構(gòu)的方法確認(rèn)，可靠性得到不到保障。4、背景菌干擾或目標(biāo)菌的狀態(tài)問(wèn)題突出：目標(biāo)菌受背景菌干擾或處于非典型狀態(tài)，很難被培養(yǎng)和檢出。某些目標(biāo)菌表型和血清型復(fù)雜，陽(yáng)性菌落易被忽視或難以確認(rèn)。5、任務(wù)繁重，工作量大而集中。6、人力、物力、時(shí)間成本大，傳統(tǒng)法檢測(cè)致病菌需要3—5天才能得到初步結(jié)果，無(wú)法滿(mǎn)足大工作量和處理突發(fā)事件的需要。

　　對(duì)乳品企業(yè)而言，自身的環(huán)境監(jiān)測(cè)和生產(chǎn)過(guò)程控制比樣品檢測(cè)更為重要。確保廠區(qū)內(nèi)潔凈作業(yè)區(qū)的設(shè)施和環(huán)境不會(huì)對(duì)產(chǎn)品帶來(lái)微生物污染，才能真正保證產(chǎn)品安全。而傳統(tǒng)的方法很難滿(mǎn)足微生物風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估、監(jiān)測(cè)和污染溯源的需求。面對(duì)日益嚴(yán)峻的微生物風(fēng)險(xiǎn)的挑戰(zhàn)，面對(duì)如此之多棘手的檢測(cè)難題，面多越來(lái)越嚴(yán)格的法規(guī)要求，乳品企業(yè)急需基于DNA分析技術(shù)的高效檢測(cè)設(shè)備以滿(mǎn)足未來(lái)的應(yīng)用需求。